Ma che modo hanno di ragionare sui Padri Apostolici?

"Ma il primato del vescovo di Roma, deriva dal fatto che egli discende da Pietro o dal fatto che egli è a Roma? "

Il fatto che Pietro abbia consacrato Clemente non vuol dire che abbia consacrato solo lui. Pietro potrebbe aver creato mille vescovi. Del resto, il papa non è altro che questo: un vescovo.
Il primato deriva non solo dal fatto che vanta una succesione apostolica (come tutti), ma dal fatto che quella succesione apostolica è quella della cattedra di Pietro, e se Pietro non venne mai a Roma, ovviamente il vescovo di Roma sarebbe indistinguibile da altri vescovi. Questo non vuol dire che la Chiesa non esisterebbe se non ci fosse il primato del vescovo di Roma, ma io ritengo che se Dio ha affidato davvero questo ministero al vescovo di Roma allora un motivo ci dev'essere, ed è che un primus per coordinare banalmente serve.